Sininen aurinko kertoo 2000-luvun alun vuosista Afganistanista. Kun taleban-hallinto Yhdysvaltain johdolla syrjäytetään, herää toivo: Tytöt pääsevät taas kouluun, naiset töihin, Afganistan tarvitsee heitä! Vähitellen käy ilmi, ettei amerikkalaisista ole pelastajiksi. Vain vuoriston ihmiset selviytyvät vuoristossa, eikä siinä maailmassa yksilöä ole ilman sukua, kylää ja heimoa.
Sininen aurinko on tarina kolmesta afgaanitytöstä. Annisa, joka haluaa käydä koulua auttaakseen pikkusisaruksiaan ja koko kylää. Vuoren takana toisessa kylässä asuva Jamila, joka voisi lukea kaikki maailman kirjat, jos vain saisi ne käsiinsä. Sekä pääkaupungissa Kabulissa asuva Farida, joka tietää olevansa etuoikeutettu, vaikka talebanit vievät myös häneltä koulun.